三维基因组结构调控基因表达的数学理论与统计推断
时间：2022-10-09
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- 演讲人： 张家军（中山大学）
- 时间：2022年10月18日 周二上午10:00
- 地点：腾讯会议 ID：143-507-672
- 主办单位：浙江大学数据科学研究中心
摘要：基于高通量染色体构象捕获(Hi-C)与单细胞转录组测序(scRNA-seq)研究发现，细胞类型特异性基因表达程序的建立和维持与转录因子、表观修饰和基因组三维构象的相互作用密切相关。我们提出了一种基于空间基因组、表观修饰组和基因转录组耦合的多尺度数学模型统一框架，以及大规模数值仿真与统计推断的方法。研究了染色质三维结构调控的基因转录爆发机制、表观遗传过程中表观修饰的稳定性与基因转录动力学的作用机制。
演讲人简介：张家军，中山大学数学学院教授，博士生导师。致力于数学与生命科学交叉研究，研究方向包括计算系统生物学、生物信息学和生物统计等。在国际重要学术期刊如PNAS、Physical Review Letters、PLoS Computational Biology、Biophysical Journal和SIAM Journal on Applied Mathematics等发表论文50余篇。主持国家自然科学基金面上项目、国家自然科学青年科学基金项目、广州市珠江科技新星专项等多项科研项目，并作为骨干成员参与多项国家自然科学重点项目等科研项目。现任中国工业与应用数学学会数学生命科学专业委员会副秘书长、中国运筹学会计算系统生物学分会副秘书长、广东省计算数学学会副理事长、中国生物信息学学会(筹)理事、中国细胞生物学学会功能基因组信息学与系统生物学分会理事、广东省工业与应用数学学会常务理事、广东省高性能计算学会理事。获2020世界华人数学家联盟最佳论文奖（若琳奖）。
联系人：蒋杭进（jianghj@zju.edu.cn）